Сравнение векторов общих слов — Русские Блоги
Эта статья тестирует несколько часто используемых методов WordEmbedding и сравнивает эффекты
Word2Vec
Это типичный представитель метода предсказания вектора слова через контекстную информацию, в основном включающую CBOW и Skip-грамм, тест CBOW + NegtiveSampling
Код:https://code.google.com/p/word2vec/
бумага:https://arxiv.org/pdf/1301.3781.pdf
Glove
Используя статистические методы для моделирования частоты встречаемости слов и их контекстных слов, в диссертации также сравниваются принципы модели с word2vec для анализа их сходств и различий;
В принципе, отправные точки двух моделей похожи, но настройка функции потерь и форма параметров различаются при моделировании (понятно?)
Код:https://github.com/stanfordnlp/GloVe
бумага:http://nlp.stanford.edu/pubs/glove.pdf
Fasttext
Когда fasttext выполняет wordEmbedding, считается, что слово состоит из английских букв, а слова, содержащие сходные буквенные структуры, должны иметь общие черты. Этот метод опирается на Word2vec и добавляет информацию о буквах в слове, чтобы помочь
Код:https://github.com/facebookresearch/fastText
бумага:https://arxiv.org/pdf/1607.04606
word2gm
Опираясь на Word2vec, считается, что слова могут иметь разную семантику в разных контекстах (более одного многозначного слова). Вектор, соответствующий слову, не достаточен, чтобы отразить этот тип информации. Рассмотрим многократное вложение слова и изучим каждый подвектор слова с помощью гауссовой модели смеси.
Код:https://github.com/benathi/word2gm
бумага:https://arxiv.org/abs/1704.08424
prob-fasttext
Fasttext рассматривает информацию о букве, но не учитывает слово polysemy. Он смешивает идеи word2gm и fasttext. Каждое слово представлено двумя результатами внедрения, один из которых является вложением букв, а другой — собственным вложением. В документе говорится, что эксперимент Показывает, что 2 встраивания достаточно для представления информации о слове
Код:https://github.com/benathi/multisense-prob-fasttext
бумага:https://arxiv.org/abs/1704.08424
Тренировочные данные:
1. Все модели используют данные text8
2. Ссылка:http://mattmahoney.net/dc/text8.zip
Тестовые данные:
1. сходство слов (сходство слов)
Примечание: используйте коэффициент Спирмена × 100
Замечания:
(1) Выше приведены точность Top1, процент (%)
Glove
Оригинальный эффект:
(1) Под двумя задачами оригинальный текстовый эффект значительно лучше, чем экспериментальный эффект
анализ:
(1) Обучающая выборка эксперимента меньше, чем бумага. Перчатка моделируется статистической частотой. Модель более общая, когда объем данных большой. Данные о продажах оказывают большое влияние на статистические результаты. В документе, когда одновременно используется Википедия 2014 + Gigaword 5, Эффект перчатки лучше, чем CBOW
fasttext
Оригинальный эффект:
(1) Схожесть слов: эффект модели лучше, чем CBOW
(2) Аналогия со словами: семантическая часть, эффект модели немного ниже, чем CBOW, грамматическая часть, эффект модели значительно лучше, чем CBOW.
анализ:
(1) Схожесть слов: эффект модели намного ниже, чем CBOW. С одной стороны, данные обучения противоречивы (статья использует Википедию). С одной стороны, статья может точно настраивать параметры. В эксперименте непосредственно используется демонстрация, предоставленная автором.
(2) Словесная аналогия: экспериментальный эффект похож на статью, семантическая часть значительно ниже CBOW, а грамматическая часть значительно лучше
word2gm
Оригинальный эффект:
(2) Аналогия со словами: в документе не используется набор данных, опубликованный в документе word2vec, но используется Baroni et al (2012). Набор данных учитывает отношение включения между словами, а в стандарте оценки используется F1-показатель
Анализ:
(1) Слова схожи: в статье используется набор данных UKWAC и Wackpedia для совместного обучения модели, а эффект word2vec в документе составляет всего 61.7, что хуже, чем обучающий эффект text8? ?
(2) Аналогия со словом: word2vec использует Точность Top1. Из экспериментального эффекта word2gm не подходит для этого стандарта оценки, и эффект очень слабый, предположим, что слово соответствует множественному встраиванию, с одной стороны, чтобы обеспечить многозначность слова, с другой С расстоянием слова невозможно получить соответствующие связанные слова из Top1, потому что могут быть другие семантические расстояния слова, которые близки к этому расстоянию
prob-fasttext
Оригинальный текстовый эффект: в статье в основном сравниваются быстрый текст и word2gm, с лучшим эффектом
анализ:
(1) С точки зрения сходства слов результаты теста соответствуют ожиданиям статьи;
(2) В сходстве слов, добавляя декомпозицию подслов, после многосемантического моделирования эффект не так хорош, как word2vec. С одной стороны, это доказывает способность обобщать алгоритм word2vec, с одной стороны, объем данных text8 может быть недостаточным для доказательства эффекта
(3) По аналогии со словом модель похожа на word2gm. Предполагается, что аналогия со словом top1 не будет иметь хорошего эффекта.
(1) Word2vec обладает сильной способностью к обобщению и все еще демонстрирует хорошую устойчивость при небольшом объеме данных.
(2) Модель, основанная на статистической частоте слов, может в большей степени зависеть от объема данных, а эффект модели, как правило, невелик при небольших данных.
(3) Что касается результатов теста, то сложная модель не может показать хороший эффект (в соответствии с познанием) при небольшом количестве данных.В сочетании с бумагой полисемия моделируемого слова и структура подслов в слове будут оказывать существенное влияние на вложение.
Выше вся моя ерунда, добро пожаловать поправить меня
Сравнение базисных векторов для представления функций Текст научной статьи по специальности «Математика»
УДК 519.6
СРАВНЕНИЕ БАЗИСНЫХ ВЕКТОРОВ ДЛЯ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ ФУНКЦИЙ
С.В. ТУЯКОВ В работе проводится сравнительный анализ локализации энергии в
частотной области некоторых вейвлетов и собственных векторов.
Белгородский
университет векторы, локализация энергии.
Постановка задачи
В вычислительной математике нередки случаи, когда одну функцию приходится представлять другой, более простой и удобной для дальнейшей работы. Такую задачу называют аппроксимацией функций [1]. Математическая теория аппроксимации предлагает выбирать базис, который с помощью линейной комбинации небольшого числа векторов из этого базиса дает возможность построить достаточно точную аппроксимацию функции. [2], например:
М
/м (1) = ‘Еак?к (1) —
к=1
где а к =(/(0,Фк(1)).
Так как базис ортонормированный, то погрешность аппроксимации равна:
+ад
||/(о — /м (I )||2 = 2 К12 •
к =М+1
Во многих важных приложениях для представления функций используется базис Фурье. При этом базис Фурье образован функцией вп = соъ(1) + у Бт( I) (у = V—Г) с помощью масштабных преобразований.
В последние десятилетия для разложения функций успешно используются вейвлеты. Можно построить вейвлеты щ(1) такие [2], что семейство растянутых и сдвинутых функций
1
\гЛ (|)=77 ¥
будет ортонормированным базисом в Ь (Я) и любая функция /(I) е Ь (Я) может быть представлена как
ад
г, к=-ад
где аг,к =(/(|),¥г,к (1)) .
Простейшим примером вейвлета, образующего ортонормированный базис, является вейвлет Хаара:
и(* )=
1, 0 < * < 1/2,
-1, 1/2 < * < 1,
0, * < 0, * > 1.
Наряду с данным вейвлетом широко используются ортогональные вейвлеты Добеши. Также имеются вейвлеты, не порождающие ортонормированные базисы: вейвлет Морле, вейвлеты Гаусса и др.
Вейвлет базисы в отличие от базиса Фурье используют локализованную базисную функцию. Вейвлет должен быть локализован и во временной области, и в частотной. В данной работе нас будет интересовать локализация вейвлетов в частотной области. Под этим понимается, что энергия вейвлета в основном сосредоточена в некотором частотном интервале.-1 (1)
—ад
и существует обратное к (1) преобразование
и
Я(ю) = 11(*)е юЖ . (2)
Функцию Я(ю) принято называть трансформантой Фурье, переменная ю имеет смысл частоты. Поэтому переход от I (*) к Я (ю) часто называют переходом из пространственной области в частотную.
В содержательном отношении преобразованиям (1) и (2) можно придать разный смысл, который и определяет роль частотных представлений в задачах анализа и синтеза функций [4]. Для функций / (*) и Я (ю) справедливо равенство Парсеваля [3]
[ 12(1 )Ж =[ (ю)| йю/2п, (3)
За «/—ад ‘ ‘
которое нетрудно преобразовать к виду
2
12 (*)Ж = V Г (ю)| Жю /2п , (4)
•юеО- 1 1
г=0
где интервалы Ок определяют разбиение оси частот вида
О, = [—П „,,—ОМП г, П )Й0 = 0. (5)
Таким образом, оказывается возможным осуществить частотный анализ энергетических характеристик исследуемой функции, так как интегралы
Рг = Г (ю)|2 йю/2п (6)
«ЮеО, 1 4 п
определяют доли энергии, попадающие в выбранные частотные интервалы, в частности, можно выделить частотные интервалы, в которых сосредоточена подавляющая доля энергии.
С учетом формулы (6) локализацию вейвлета в частотной области можно записать следующим образом
(ю)2 Жю / 2п = тах, (7)
при дополнительном условии ||и(* )|2 = 1 .
В монографии [4] приводится метод вычисления точных долей энергии отрезка эмпирических данных в выбранных частотных интервалах. Особенностью приведенного метода является то, что все вычисления производятся во временной области, без явного перехода в частотную область. В основе метода лежит применение матриц. В монографии дается обоснование именовать данные матрицы субполосными.
Пусть дан сигнал f = (/1 , f2 ,…, fN )T с f
= 1 (T — знак транспонирования). То-
гда вычисление доли энергии сигнала в заданном частотном диапазоне осуществляется по следующей формуле (8) [4]:
P = f an f,
(В)
где AN = {a[k } с элементами вида (9):
яя sin[r —(i — k)] — sin[(r -1) —(i — k)] КК
я(і — k)
i Ф k
(9)
Ук,i = k
где і,к = 1,…,Ы,г = 1,…,Я.
Для расчетов используется нормированная область частот [0 : л] .Частотная область [0;л] разбивается на Я одинаковых частотных интервалов. ЛГЫ — субполосная матрица.
Субполосные матрицы являются симметричными и неотрицательно определенными. Поэтому каждая матрица обладает полной системой ортогонормальных собственных векторов, соответствующих неотрицательным собственным числам. Имеет смысл трактовать такую систему векторов базисом.
Насколько вейвлеты удовлетворяют условию (7)? Решим следующую задачу.
Задача. Найти вектор x = (x15x2,…,xN)T , дующему условию
11Xd (a)|2 da / 2я = max,
= 1, который удовлетворяет сле-
(10)
®єУг
Xd(a) = 2xke Mk 1) (- я < a < я),
k=1
Vr = [- vr+1 ,-Vr MVr > vr+1 ), v0 = 0 ,
~Vr) ^ lvr , vr
0 < vr+1 < я .
Используя метод точного вычисления доли энергии вектора, функционал (10) можно записать следующим образом:
x ANx = 2 ai kxixk = max
, k=1
Необходимо найти частные производные. Учитывая, что
(її)
= 1 , т.е. это явля-
ется максимумом, поэтому находим частные производные следующим образом и приравниваем их к нулю:
_д_
dx
N
N
Л
i
2 ‘
i,k=1
— ^2 xi
i=1 j
=0.х = Ах. (13)
Последняя формула определяет собственный вектор субполосной матрицы.
Ответ: искомым вектором х = (х1,х2,…,хы)Т является собственный вектор субполосной матрицы ЛГЫ , соответствующий ее максимальному собственному числу.
aik =
2
Следует отметить важное свойство собственных чисел субполосной матрицы. Это свойство заключается в том, что собственные числа численно равны сосредоточенным в выбранных частотных интервалах долям энергий соответствующих собственных векторов [4].
Локализация энергии вейвлетов и собственных векторов в частотной области
Оценим локализацию энергии вейвлетов и собственных векторов в частотной области. Для этого найдем границы частотного интервала, в котором сосредоточенно подавляющая доля энергии (например, больше 0,99).
Для краткости будем обозначать субполосную матрицу следующим образом Лгы Я, где Я — количество частотных интервалов, N — размерность матрицы, а г — номер частотного интервала. Собственные векторы субполосной матрицы будем обозначать qrk, где г — номер частотного интервала, к — номер собственного вектора. Будем
исследовать собственные векторы субполосных матриц Лгы Я, при N = 26, Я = 4, соответствующих максимальным собственным числам и по виду, «близких» рассматриваемым вейвлетам. В примерах с 1-ого по 6-ой для дискретного случая вейвлеты и собственные векторы строятся по 26 точкам. Полученный в результате дискретизации вейвлета вектор нормируем.
Пример 1. Вейвлет Морле. Вейвлет имеет аналитическое выражение —
/(х) = е 2 cos(5х) .6 Я = 4 .
Рис. 4. Собственный вектор д\4 (слева), модуль его трансформанты Фурье (справа)
Пример 5. Вейвлет Гаусса 1-го порядка. Вейвлет функция щ(х) = -2кхех , где к выбирается такой, чтобы Ь2 -норма функции х) равнялась 1. В данном случае к « 0,8933. Вейвлет имеет эффективный носитель [- 5; 5]. Преобразование Фурье данного вейвлета имеет компактный носитель — [-7;7], поэтому шаг эквидистантной дис-
я я
кретизации должен удовлетворять условию: Д: < — = —.
О 7
0.5
С’5
А
\ 2
Г\г [ 5
1 0. Я = 4 . о*—————————— э<£
-5 0 Е 0 ъА т/2 З-н т и
Рис. 6. Собственный вектор (- д\5 ) (слева),
модуль его трансформанты Фурье (справа)
Пример 7. Вейвлет Добеши 2-го порядка. Вейвлеты Добеши не имеют аналитического выражения. Носитель вейвлета — [0;3]. Функция х) строится итерационно с
необходимой точностью.
Алгоритм построения функции х)
1. Выписать коэффициенты масштабирующего фильтра:
Ь = [0.3415,0.5915,0.1585,-0.0915]
2. Найти к фильтру 1_ квадратурный зеркальный фильтр, взятый в обратном порядке: Н = [ -0.25 ) Л26 К = 4 0,9999 0 п
Вейвлет Добеши 2 0,9992 0 п
Собственный вектор д378 (Л382 К = 20) 1 0 •I- 0
Последний столбец таблицы 1 показывает локализацию энергии вейвлетов и собственных векторов.
Литература
1. Лапчик М.П. Численные методы: Учеб. пособие для студ. вузов [Текст] /М.П. Лапчик, М.И. Рагулина, Е.К. Хеннер; Под ред. М.П. Лапчика. — 2-е изд., стер. — М.: Издательский центр «Академия», 2005. — 384 с.
2. Малла С. Вэйвлеты в обработке сигналов [Текст] : Пер. с англ. — М.: Мир, 2005. — 671 с., ил.
3. Хургин Я.И., Яковлев В.П. Финитные функции в физике и технике.- М.: Наука, 1971.
4. Е.Г. Жиляков. Вариационные методы анализа и построения функций по эмпирическим данным: монография. Белгород: Изд-во БелГУ, 2007. — 160 с.
COMPARISON OF BASIS VECTORS FOR REPRESENTATION OF FUNCTIONS
S.V. TUYAKOV In work the comparative analysis of localization of energy in fre-
quency area of some wavelets and eigenvectors is carried out.
Belgorod State University
Key words: frequency representations, wavelets, eigenvectors, localization of power.
Сравнение векторов и мультимедийных расширений
Как и мультимедийные расширения, имеющиеся в инструкциях x86 SSE, векторные инструкции определяют сразу несколько операций. Но мультимедийные расширения обычно определяют лишь небольшое их количество, в то время как векторные определяют десятки операций. В отличие от мультимедийных расширений, количество элементов в векторной операции определяется не в коде операции, а в отдельном регистре. Это означает, что разные версии векторной архитектуры могут быть реализованы с разным количеством элементов путем простого изменения содержимого этого регистра и, следовательно, сохранить двоичную совместимость. В отличие от этого, новый более крупный набор кодов операций всякий раз добавляет в мультимедийное расширение архитектуры x86 изменения длины вектора.
Также, в отличие от мультимедийных расширений, передача данных не нуждается в их смежности. Векторы поддерживают как пошаговые доступы, при которых оборудование загружает в память каждый n-ный элемент данных, так и индексированные доступы, при которых оборудование находит адреса загружаемых элементов в векторном регистре.
Как и мультимедийные расширения, вектор легко приспосабливается к гибкости в длине данных, поэтому заставить операции работать с 32 64-разрядными элементами данных, или с 64 32-разрядными элементами данных, или со 128 16-разрядными элементами данных, или с 256 8-разрядными элементами данных довольно просто.
В общем, векторные архитектуры являются довольно эффективным средством выполнения программ, занимающихся параллельной обработкой данных, они лучше соответствуют технологиям компилирования, нежели мультимедийные расширения, и им проще развиваться с течением времени, чем мультимедийным расширениям для архитектуры x86.
Уточнение. Почему же имеющие такие преимущества вектора не стали более популярными за пределами высокопроизводительных вычислений? Высказывались серьезные беспокойства насчет того, что векторные регистры увеличивают время переключения контекста, а также насчет сложности обработки ошибок отсутствия страниц при загрузках и сохранениях векторов, и утверждалось, что SIMD-инструкции достигли некоторых преимуществ векторных инструкций. Но в последних новостях компании Intel были намеки на то, что роль векторов будет расти. Технология INTEL под названием «усовершенствованные векторные инструкции» Advanced Vector Instructions (AVI) сможет мгновенно расширять SSE-регистры со 128 до 256 разрядов и допускать их расширение вплоть до 1024 разрядов. Последнее расширение эквивалентно 16 числам с плавающей точкой, имеющим двойную точность. Пока непонятно, будут ли при этом представлены инструкции загрузки и сохранения векторов. Кроме того, считается, что в процессоре Larrabee, проникновение Intel на рынок дискретных графических процессоров имеются векторные инструкции.
Уточнение. Еще одно преимущество векторов и мультимедийных расширений состоит в относительной простоте дополнения архитектуры набора скалярных инструкций инструкциями, использующими эти технологии для улучшения производительности операций параллельной обработки данных.
с вашего сайта.
Разработка и получение вирусных векторов
Dr. Johannes van der Loo
За последние почти 40 лет складывается впечатление, что генная терапия развивалась, делая шаг вперед, а затем два шага назад.Благодаря таким ученым, как доктор Йоханнес (Хан) ван дер Лу, такое положение может измениться.
Будучи первопроходцем в разработке моделей получения вирусных векторов, д-р ван дер Лу предсказывает для генной терапии в ближайшие годы только поступательный импульс. И он не одинок.
В 2015 году размер рынка генной терапии онкологических заболеваний составлял 805,5 млн. долл. США, при этом среднегодовой темп роста по прогнозам должен был превышать 20 % до 2024 года. 1 Эксперты прогнозируют, что рынок генной терапии в 2025 году составит 11 млрд. долл. США. 2
Это впечатляющий рост для области исследований, где на сегодняшний день получено всего пять одобренных к применению средств, причем только одно из них поступило в коммерческую продажу за пределами Азии (и то только в странах ЕС). 2
Однако д-р ван дер Лу отмечает, что новые методы генной терапии уже находятся на поздних стадиях разработки, и еще на подходе по всему миру есть другие.
И это даст генной терапии мощный импульс продолжать важные исследования в области разработки безопасных вирусных векторов, которые в будущем доставят в нужную точку спасающие жизнь лекарства.
Категории и типы вирусных векторов
Д-р ван дер Лу объясняет, что в генной терапии векторы делятся на три основные категории:
1. Интегрирующие вирусные векторы (например, гаммаретровирус и лентивирус), которые интегрируются в геном клетки-мишени и таким образом реплицируются в дочерние клетки в результате митоза.
2. Неинтегрирующие вирусные векторы (например, аденовирус и аденоассоциированный вирус), которые остаются эписомными, тем самым потенциально снижая онкогенез.
3. Невирусные векторы, например, плазмидная ДНК.
Другими распространенными типами вирусных векторов являются альфавирус, вирус герпеса и вакциния.
При выборе вирусного вектора, – говорит доктор ван дер Лу, – сначала необходимо решить, какой вектор вам нужен, интегрирующий или неинтегрирующий.
«Если, например, целью является гемопоэтическая стволовая клетка, которая будет делиться и производить многочисленное потомство, – поясняет он, – лучшим выбором является интегрирующий вирусный вектор, потому что интегрированный ген будет передаваться в дочерние клетки. Однако если ткань состоит из неделящихся клеток, мы можем использовать неинтегрирующий вектор».
Дополнительными соображениями будут избирательность вирусного вектора, тип клеток, на которые он нацелен, и потенциальные проблемы токсичности и генотоксичности.
С тех пор, как в 2002 году обнаружилось, что у некоторых пациентов, которым был проведен перенос генов с помощью гаммаретровирусных векторов, вследствие инсерционного мутагенеза развилась лейкемия 3, в генной терапии на основе клеток стал учитываться риск генотоксичности. Этот риск ассоциируется не только с интегрирующими ретровирусными векторами, но и с неинтегрирующими векторами, такими как AAV. 4 Хотя низкая иммуногенность вектора AAV до сих пор не вызывала острых побочных эффектов, в нескольких клинических исследованиях она вызывала иммунотоксичность, которая могла препятствовать достижению терапевтических результатов. 5,6
Наконец, важно учитывать стабильность вирусного вектора in vitro и in vivo, а также определить наилучший способ его безопасного получения и очистки. Здесь-то и выходят на сцену д-р ван дер Лу и его коллеги.
Сравнение методов получения вирусных векторов
«Существует три основных способа получения вирусных векторов: использование стабильной пакующей клеточной линии, использование переходной трансфекции и использование инфекции», – объясняет д-р ван дер Лу. «Под методом, использующим инфекцию, я имею в виду бакуловирусную систему, разработанную Робертом Котиным, когда он работал исследователем в Национальном институте здравоохранения. Для упрощения я остановлюсь в этой статье только на двух других методах».Он начинает с изложения основ: Использование стабильной линии-производителя подразумевает стабильно интегрированные гены Gag/Pol и env, необходимые для создания вирусной частицы. Но здесь отсутствует сама векторная последовательность, которая обычно вводится в виде вируса или плазмиды. Поскольку использование плазмиды является неэффективным методом получения вирусного вектора, способного к интеграции, то их обычно получают с использованием вируса.
Затем клетки выращивают, выбирают клон, а затем из этого клона создается маточный банк клеток. После того, как маточный банк клеток будет создан и сертифицирован, как только клеткам позволят оттаять и поместят их в питательную среду, они начнут производить вирусный вектор.
Производство с помощью стабильной линии-производителя относительно несложно и легко масштабируется. Обычно партии мало варьируют между собой, хотя этот метод по своей сути не столь гибкий.
«После того, как вы выберете вирусный вектор и последовательность генов, у вас больше не остается выбора, – говорит д-р ван дер Лу, – потому что когда вы отберете свои клоны и создадите маточный банк клеток, вы не сможете больше вносить никакие изменения».
В отличие от использования стабильных линий-производителей, для переходной трансфекции требуется всего три дня, причем все векторы производятся из одного маточного банка клеток.
«Таким образом, получение партии векторов становится относительно быстрым и чрезвычайно гибким, так как вектор можно изменять вплоть до момента получения», – говорит он.
Однако производство здесь более сложное и трудно масштабируемое, чем при использовании стабильной линии-производителя, и если процесс не будет контролироваться надлежащим образом, возможен разброс от партии к партии. Одной из причин этого является то, что процесс переходной трансфекции неизменно связан с загрязнением плазмидами, которые необходимо удалить при производстве и очистке.
Очистка вирусных частиц ультрацентрифугированием
Одним из методов, которые д-р ван дер Лу и его коллеги используют для очистки вирусных частиц, является ультрацентрифугирование в градиенте плотности, которое эффективно разделяет полные и пустые вирионы. В качестве изоосмотического раствора для всех плотностей, необходимых для этого метода, можно использовать йодиксанол.Учитывая критический характер дальнейшего использования продукта, соблюдение требований GMP при ультрацентрифугировании является ключевой необходимостью. Важно понимать, что пробирки и крышки поставляются нестерильными, а стерилизация – гамма излучение, обработка окисью этилена или термическая обработка – может нарушить целостность пробирки.
«Поэтому мы всегда изучаем информацию изготовителей этих материалов о химической совместимости и допустимой стерилизации», – говорит он. «И если процесс используется для последующих клинических испытаний, то метод должен пройти валидацию».
Далее он описывает основной процесс очистки, который использовал он сам и его коллеги:
«После добавления вируса, который имеет самую низкую плотность, мы вводим под него слой йодиксанола с различными концентрациями, – говорит он, – и следим за тем, чтобы мениск находился чуть ниже ниппеля пробирки.
«Затем пробирку запечатывают, и после центрифугирования вирус собирается в зоне 40 % концентрации йодиксанола, поверх зоны с 54 % концентрацией. После того, как мы вставим иглу в верхнюю часть пробирки, чтобы уравновесить давление, мы вводим другую иглу сбоку в пробирку для отбора вируса».
Поскольку этот процесс нестерильный, – отмечает он, – необходимо перед запуском продезинфицировать ротор, а перед отбором вируса протереть пробирку. И наконец, д-р ван дер Лу советует профильтровать конечный продукт, используя фильтр, по меньшей мере, 0,2 мкм.
Он также отмечает, что этот процесс требует тщательной подготовки персонала, потому что он высокоэффективен в той же степени, что и сложен. «Мы успешно использовали его для получения векторов AAV для клинического исследования фазы IIA, – говорит он, – что потребовало от нас применения в общей сложности 480 градаций йодиксанола».
Клинические проблемы при использовании вирусных векторов в генной терапии
Использование сложных молекулярных процессов, сформировавшихся на протяжении миллионов лет эволюции – нашей и вирусов – не проходит без проблем, как признает доктор ван дер Лу.«Начнем с того, что огромная проблема заключается в том, чтобы выявить и обеспечить соответствующий уровень генной коррекции, необходимый для конкретного заболевания», – говорит он. «Это и необходимое количество копий, и количество интеграций для встраивания векторов, и количество клеток, которые должны быть преобразованы».
«Во-вторых, важно определить уровень экспрессии терапевтического гена; обычно он зависит от выбора промотора – сильного или слабого – который определяет, какого уровня экспрессии мы достигнем, высокого или низкого».
«В-третьих, это потенциальная возможность инсерционного мутагенеза. Мы знаем, что векторы, которые интегрируются в геном, могут влиять на гены в области интеграции, и устранение потенциальной возможности инсерционного мутагенеза представляет собой постоянную проблему».
«Четвертой проблемой является подавление экспрессии генов, которая является важным фактором для интеграции векторов, развития иммунного ответа на вектор (который определяет выбор способа введения), типа и чистоты вектора и биораспределения вещества после его введения в организм».
«Наконец, мы должны учитывать побочную экспрессию, хотя мы знаем, что использование специфичных для тканей промоторов может помочь решить эту проблему».
Другие извлеченные уроки
Какие уроки из тех, что доктор ван дер Лу извлек за многие годы работы в области генной терапии, он считает самыми важными?
«На ранних стадиях клинических испытаний важно провести риск-ориентированную оценку всего сырья по критическим критериям эффективности и, если возможно, заключить соглашение о качестве со всеми поставщиками материалов».
Он также понял важность использования формализованного технологического процесса при переносе процессов от разработки к GMP. «И никогда не следует недооценивать тот высокий уровень технической подготовки, который необходимо обеспечить, прежде чем вы будете готовы к началу производства», – отмечает он.
«Наконец, для крупномасштабного производства инвестируйте в масштабируемые технологии. В некоторых случаях это может быть ультрацентрифугирование, в других имеет смысл рассмотреть такие альтернативы, как хроматография».
Список литературы
- URL: https://globenewswire.com/news-release/2016/09/13/871431/0/en/Cancer-Gene-Therapy-Market-size-to-exceed-4-3bn-by-2024-Global-Market-Insights-Inc.html.
- URL: https://www.rootsanalysis.com/reports/view_document/gene-therapy-market-2015-2025/85.html.
- Hacein-Bey-Abina S, Hauer J, Lim A, et al. Efficacy of gene therapy for X-linked severe combined immunodeficiency. N Engl J Med 2010;363(4):355–364.
- Kaeppel C, Beattie SG, Fronza R, et al. A largely random AAV integration profile after LPLD gene therapy. Nat Med 2013;19(7):889–891.
- Masat E, Pavani G, Mingozzi F. Humoral immunity to AAV vectors in gene therapy: challenges and potential solutions. Discov Med 2013;15(85):379–389.
- Mingozzi F, High KA. Immune responses to AAV vectors: overcoming barriers to successful gene therapy. Blood 2013;122(1): 23–36.
эффективность российских «Спутника V», «ЭпиВакКороны» и «КовиВака»
https://ria.ru/20201207/vaktsina-covid-19-1587971785.html
Сравнение российских вакцин от COVID-19: эффективность и срок защиты
Сравнение вакцин от COVID-19: эффективность российских «Спутника V», «ЭпиВакКороны» и «КовиВака»
Сравнение российских вакцин от COVID-19: эффективность и срок защиты
В настоящее время российские медучреждения используют для прививки от COVID-19 четыре вакцины — «Спутник V», или «Гам-КОВИД-Вак», и «Спутник Лайт» Центра имени… РИА Новости, 18.08.2021
2020-12-07T10:54
2020-12-07T10:54
2021-08-18T11:15
инфографика
медицина
здравоохранение
прививки
государственный научный центр вирусологии и биотехнологий «вектор»
коронавирусы
нии им. гамалеи (национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика н.ф.гамалеи)
россия
/html/head/meta[@name=’og:title’]/@content
/html/head/meta[@name=’og:description’]/@content
https://cdn25.img.ria.ru/images/07e4/0c/07/1587974432_1:0:1999:1124_1920x0_80_0_0_8d5a064efa54725cb9f2a1a8c823fe0b.png
В настоящее время российские медучреждения используют для прививки от COVID-19 четыре вакцины — «Спутник V», или «Гам-КОВИД-Вак», и «Спутник Лайт» Центра имени Н. Ф. Гамалеи, «ЭпиВакКорону» новосибирского «Вектора» и «КовиВак» Центра имени М. П. Чумакова. Мы сравнили ключевые характеристики этих препаратов. Кому они противопоказаны, какие побочные эффекты вызывают и насколько продолжительным будет действие — в инфографике Ria.ru. Сравнение российских вакцин от COVID-19Россия первой в мире зарегистрировала вакцину от COVID-19 («Спутник V») и начала прививочную кампанию. Сейчас в медучреждениях страны используют четыре препарата — кроме «Спутника» в гражданский оборот поступили «ЭпиВакКорона», «КовиВак» и «Спутник Лайт». Все отечественные вакцины прошли первую и вторую фазы клинических испытаний, разработчики приступили к пострегистрационным исследованиям. «Спутник V» («Гам-КОВИД-Вак», Центр им. Н. Ф. Гамалеи)Конструкция и эффективность»Спутник V» создан на основе аденовируса человека. В вакцине этот вирус лишен способности размножаться, его используют как транспорт — он доставляет в клетку генетический материал коронавируса SARS-CoV-2. В результате организм начинает производить S-белок коронавируса, который и вызывает иммунный ответ. Эффективность первой отечественной вакцины превышает 91%. ПротивопоказанияВ списке противопоказаний «Спутника V» тяжелые формы аллергии, острые инфекционные и неинфекционные заболевания, обострение хронических патологий, грудное вскармливание, гиперчувствительность к одному из компонентов препарата, а также возраст до 18 лет. Использовать этот препарат для прививки людей с аутоиммунными и онкологическими болезнями нужно с осторожностью. 25 июня Минздрав разрешил применение «Спутника» во время беременности. Побочные эффекты и продолжительность защитыПобочные эффекты могут развиться в первые-вторые сутки после инъекции. Обычно они проходят в течение трех дней. Среди нежелательных явлений — озноб, головная боль, повышение температуры, боль в мышцах и суставах, общее недомогание, неприятные ощущения, отек и покраснение в месте укола. Как правило, побочные действия имеют легкую и среднюю степень выраженности. Продолжительность защиты «Спутника V», по предварительным данным, составит два года. «Спутник Лайт» (Центр им. Н. Ф. Гамалеи)»Спутник Лайт» — это первая доза «Спутника V». Она используется для ревакцинации переболевших коронавирусной инфекцией, а также как однокомпонентная вакцина в ситуации, когда нужно быстро сбить пик эпидемии. Список противопоказаний и побочных эффектов у «Спутников» одинаковый. Эффективность у лайт-версии ниже — 79,4%. Она защищает от COVID-19 в течение 4–5 месяцев.»ЭпиВакКорона» («Вектор» Роспотребнадзора)Конструкция и эффективность»ЭпиВакКорона» состоит из искусственно синтезированных коротких фрагментов S-белка коронавируса — пептидов, которые прикреплены к белку-носителю. Как и «Спутник V», вакцина вызывает выработку антител к S-белку. Обнаружить их в организме позволяет тест-система с высокой чувствительностью «SARS-CoV-2-IgG-Вектор». По данным разработчиков, 95,8% привитых «ЭпиВакКороной» не заболели после контакта с инфекцией. ПротивопоказанияПротивопоказания к применению «ЭпиВакКороны» во многом схожи с перечнем «Спутника». Ее также нельзя использовать при тяжелых формах аллергии, острых инфекционных и неинфекционных заболеваниях, обострении хронических патологий, грудном вскармливании, гиперчувствительности к одному из компонентов препарата и до 18 лет. Из других противопоказаний — первичный иммунодефицит, рак крови и новообразования, беременность. Побочные эффекты и продолжительность защитыВ инструкции «ЭпиВакКороны» указаны два побочных эффекта — кратковременное повышение температуры не более 38,5 градусов и боль в месте укола. Согласно классификации ВОЗ, эти нежелательные явления встречались у 1–10% привитых. По прогнозу, защитного действия препарата хватит на один год. «КовиВак» (Центр им. М. П. Чумакова)Конструкция и эффективность»КовиВак» — единственная российская вакцина, сделанная по классической методике, — она содержит цельный коронавирус, а не его части. Сам вирус при этом деактивирован (убит). Благодаря такой конструкции после прививки в организме вырабатываются антитела не только к S-белку, но и к другим фрагментам возбудителя. Эффективность препарата — более 90%.Противопоказания»КовиВак» противопоказан при тяжелых формах аллергии, острых инфекционных и неинфекционных заболеваниях, обострении хронических патологий, беременности, грудном вскармливании и до 18 лет. Кроме того, не стоит использовать препарат, если раньше после вакцинации возникали серьезные осложнения.Побочные эффекты и продолжительность защитыСогласно инструкции, побочные эффекты могут наблюдаться в первые-третьи сутки после инъекции. Как правило, они не тяжелые и исчезают на третий день. Чаще всего появляется головная боль, неприятные ощущения и уплотнение в месте укола, реже вакцинация приводит к повышению температуры. Как долго «КовиВак» будет защищать от COVID-19, пока неизвестно.
россия
РИА Новости
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
2020
РИА Новости
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
Новости
ru-RU
https://ria.ru/docs/about/copyright.html
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/
РИА Новости
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
https://cdn23.img.ria.ru/images/07e4/0c/07/1587974432_251:0:1750:1124_1920x0_80_0_0_624623245d6ae46a2455985455c0ca88.pngРИА Новости
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
РИА Новости
7 495 645-6601
ФГУП МИА «Россия сегодня»
https://xn--c1acbl2abdlkab1og.xn--p1ai/awards/
медицина, здравоохранение, прививки, государственный научный центр вирусологии и биотехнологий «вектор», коронавирусы, нии им. гамалеи (национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика н.ф.гамалеи), россия, коронавирус covid-19, коронавирус в россии, вакцина «спутник v», вакцина «эпиваккорона», вакцинация россиян от covid-19, центр им. м. п. чумакова, инфографика
В настоящее время российские медучреждения используют для прививки от COVID-19 четыре вакцины — «Спутник V», или «Гам-КОВИД-Вак», и «Спутник Лайт» Центра имени Н. Ф. Гамалеи, «ЭпиВакКорону» новосибирского «Вектора» и «КовиВак» Центра имени М. П. Чумакова. Мы сравнили ключевые характеристики этих препаратов. Кому они противопоказаны, какие побочные эффекты вызывают и насколько продолжительным будет действие — в инфографике Ria.ru.
Сравнение российских вакцин от COVID-19
Россия первой в мире зарегистрировала вакцину от COVID-19 («Спутник V») и начала прививочную кампанию. Сейчас в медучреждениях страны используют четыре препарата — кроме «Спутника» в гражданский оборот поступили «ЭпиВакКорона», «КовиВак» и «Спутник Лайт». Все отечественные вакцины прошли первую и вторую фазы клинических испытаний, разработчики приступили к пострегистрационным исследованиям.
Спутник V | Спутник Лайт | ЭпиВакКорона | КовиВак | |
Количество доз | 2 | 1 | 2 | 2 |
Эффективность | 91,6% | 79,4% | н/д | >90% |
Продолжитель-ность защиты | 2 года | 4–5 мес. | 1 год | н/д |
Возраст | 18+ | 18–60 лет | 18+ | 18–60 лет |
Побочное действие | Озноб, повышение температуры, боль в мышцах и суставах, общее недомогание, головная боль | Озноб, повышение температуры, боль в мышцах и суставах, общее недомогание, головная боль | Кратковремен- ное повышение температуры не более 38,5 °С | Кратковремен- ное повышение температуры, головная боль |
«Спутник V» («Гам-КОВИД-Вак», Центр им. Н. Ф. Гамалеи)
Конструкция и эффективность
«Спутник V» создан на основе аденовируса человека. В вакцине этот вирус лишен способности размножаться, его используют как транспорт — он доставляет в клетку генетический материал коронавируса SARS-CoV-2. В результате организм начинает производить S-белок коронавируса, который и вызывает иммунный ответ. Эффективность первой отечественной вакцины превышает 91%.
Противопоказания
В списке противопоказаний «Спутника V» тяжелые формы аллергии, острые инфекционные и неинфекционные заболевания, обострение хронических патологий, грудное вскармливание, гиперчувствительность к одному из компонентов препарата, а также возраст до 18 лет. Использовать этот препарат для прививки людей с аутоиммунными и онкологическими болезнями нужно с осторожностью. 25 июня Минздрав разрешил применение «Спутника» во время беременности.
Побочные эффекты и продолжительность защиты
Побочные эффекты могут развиться в первые-вторые сутки после инъекции. Обычно они проходят в течение трех дней. Среди нежелательных явлений — озноб, головная боль, повышение температуры, боль в мышцах и суставах, общее недомогание, неприятные ощущения, отек и покраснение в месте укола. Как правило, побочные действия имеют легкую и среднюю степень выраженности. Продолжительность защиты «Спутника V», по предварительным данным, составит два года.
«Спутник Лайт» (Центр им. Н. Ф. Гамалеи)
«Спутник Лайт» — это первая доза «Спутника V». Она используется для ревакцинации переболевших коронавирусной инфекцией, а также как однокомпонентная вакцина в ситуации, когда нужно быстро сбить пик эпидемии. Список противопоказаний и побочных эффектов у «Спутников» одинаковый. Эффективность у лайт-версии ниже — 79,4%. Она защищает от COVID-19 в течение 4–5 месяцев.
«ЭпиВакКорона» («Вектор» Роспотребнадзора)
Конструкция и эффективность
«ЭпиВакКорона» состоит из искусственно синтезированных коротких фрагментов S-белка коронавируса — пептидов, которые прикреплены к белку-носителю. Как и «Спутник V», вакцина вызывает выработку антител к S-белку. Обнаружить их в организме позволяет тест-система с высокой чувствительностью «SARS-CoV-2-IgG-Вектор». По данным разработчиков, 95,8% привитых «ЭпиВакКороной» не заболели после контакта с инфекцией.
Противопоказания
Противопоказания к применению «ЭпиВакКороны» во многом схожи с перечнем «Спутника». Ее также нельзя использовать при тяжелых формах аллергии, острых инфекционных и неинфекционных заболеваниях, обострении хронических патологий, грудном вскармливании, гиперчувствительности к одному из компонентов препарата и до 18 лет. Из других противопоказаний — первичный иммунодефицит, рак крови и новообразования, беременность.
Побочные эффекты и продолжительность защиты
В инструкции «ЭпиВакКороны» указаны два побочных эффекта — кратковременное повышение температуры не более 38,5 градусов и боль в месте укола. Согласно классификации ВОЗ, эти нежелательные явления встречались у 1–10% привитых. По прогнозу, защитного действия препарата хватит на один год.
«КовиВак» (Центр им. М. П. Чумакова)
Конструкция и эффективность
«КовиВак» — единственная российская вакцина, сделанная по классической методике, — она содержит цельный коронавирус, а не его части. Сам вирус при этом деактивирован (убит). Благодаря такой конструкции после прививки в организме вырабатываются антитела не только к S-белку, но и к другим фрагментам возбудителя. Эффективность препарата — более 90%.
Противопоказания
«КовиВак» противопоказан при тяжелых формах аллергии, острых инфекционных и неинфекционных заболеваниях, обострении хронических патологий, беременности, грудном вскармливании и до 18 лет. Кроме того, не стоит использовать препарат, если раньше после вакцинации возникали серьезные осложнения.
Побочные эффекты и продолжительность защиты
Согласно инструкции, побочные эффекты могут наблюдаться в первые-третьи сутки после инъекции. Как правило, они не тяжелые и исчезают на третий день. Чаще всего появляется головная боль, неприятные ощущения и уплотнение в месте укола, реже вакцинация приводит к повышению температуры. Как долго «КовиВак» будет защищать от COVID-19, пока неизвестно.
1
Первый слайд презентации: Сравнение теорем о циркуляции векторов и
Электростатическое поле – потенциальное. Магнитное поле – вихревое.
Изображение слайда
2
Слайд 2: Контур с током в магнитном поле
Магнитный дипольный момент замкнутого контура с током I : – площадь поверхности, ограниченной контуром – единичный вектор нормали к плоскости контура — вектор площадки ,, направлены плоскости контура так, что из их концов ток в контуре виден идущим против часовой стрелки.
Изображение слайда
3
Слайд 3: Контур с током в магнитном поле
Можно показать, что вращающий момент сил, действующий на рамку с током в магнитном поле, равен В магнитном поле контур с током будет ориентироваться так, чтобы вектор магнитного момента совпадал с вектором внешнего поля.
Изображение слайда
4
Слайд 4: Одно из определений
Магнитная индукция численно равна отношению вращающего момента, действующего в магнитном поле на небольшую рамку с током, к магнитному моменту рамки при такой ее ориентации в поле, когда это отношение достигает максимального значения; по направлению вектор совпадает с вектором магнитного момента рамки, находящегося в положении устойчивого равновесия в рассматриваемой точке поля.
Изображение слайда
5
Слайд 5: Поток вектора магнитной индукции
Магнитный поток (поток вектора магнитной индукции) сквозь малую поверхность площадью — единичный вектор нормали к площадке — проекция вектора на направление нормали Поток вектора магнитной индукции
Изображение слайда
6
Слайд 6
Магнитный поток сквозь произвольную поверхность
Изображение слайда
7
Слайд 7: Теорема Остроградского-Гаусса для магнитного поля
Магнитный поток сквозь произвольную замкнутую поверхность равен нулю: Этот результат является математическим выражением того, что в природе нет «магнитных» зарядов – источников магнитного поля, на которых начинались бы или заканчивались линии магнитной индукции.
Изображение слайда
8
Слайд 8: Работа перемещения проводника с током в постоянном магнитном поле
— вектор малой площадки, прочерчиваемой элементом проводника при его малом перемещении — магнитный поток сквозь площадку Элементарная работа, совершаемая силой Ампера при малом перемещении в постоянном магнитном поле малого элемента проводника с током равна
Изображение слайда
9
Слайд 9: Работа по перемещению контура с током
Если = const — Работа сил Ампера при перемещении в магнитном поле замкнутого контура с током Работа сил Ампера при перемещении в постоянном магнитном поле замкнутого контура, электрический ток в котором поддерживается постоянным, равна произведению силы тока в контуре на изменение его магнитного потока.
Изображение слайда
10
Слайд 10
Магнитное поле в веществе
Изображение слайда
11
Слайд 11: Магнитные моменты атомов
Согласно представлениям классической физики электроны в атоме движутся по замкнутым траекториям – орбитам, образуя систему замкнутых орбитальных токов. Если электрон движется со скоростью по круговой орбите радиуса сила орбитального тока – заряд электрона – частота обращения электрона по орбите
Изображение слайда
12
Слайд 12: Орбитальный магнитный момент электрона
— площадь орбиты
Изображение слайда
13
Слайд 13: Орбитальный момент импульса электрона
– масса электрона — его радиус-вектор, проведенный из центра орбиты
Изображение слайда
14
Слайд 14: Связь между векторами и
— Гиромагнитное отношение
Изображение слайда
15
Слайд 15: ДИАМАГНЕТИКИ И ПАРАМАГНЕТИКИ В МАГНИТНОМ ПОЛЕ
Изображение слайда
16
Слайд 16
Все вещества при рассмотрении их магнитных свойств принято называть магнетиками. МАГНЕТИКИ ДИАМАГНЕТИКИ ПАРАМАГНЕТИКИ ФЕРРОМАГНЕТИКИ
Изображение слайда
17
Слайд 17
Всякая среда при внесении ее во внешнее магнитное поле намагничивается в той или иной степени, т.е. создает свое собственное магнитное поле, накладывающееся на внешнее магнитное поле.
Изображение слайда
18
Слайд 18: Намагниченность
— магнитный момент единицы объема магнетика. — магнитный момент -го атома (молекулы) из общего числа атомов (молекул), содержащихся в макроскопически малом объеме (- количественная характеристика намагниченного состояния).
Изображение слайда
19
Слайд 19: Диамагнетики
— вещества, которые намагничиваются во внешнем магнитном поле в направлении, противоположном направлению вектора магнитной индукции поля. К диамагнетикам относятся вещества, магнитные моменты атомов, молекул или ионов которых в отсутствии внешнего магнитного поля равны нулю. При внесении во внешнее магнитное поле диамагнетик намагничивается, создавая собственное магнитное поле, направленное против внешнего поля и ослабляющее его. (напр., инертные газы, )
Изображение слайда
20
Слайд 20: Парамагнетики
— вещества, которые намагничиваются во внешнем магнитном поле в направлении вектора Атомы (молекулы или ионы) парамагнетика обладают магнитным моментом. В отсутствии магнитного поля парамагнетик не намагничен, т.к. из-за теплового движения собственные магнитные моменты атомов ориентированы беспорядоченно. При внесении во внешнее магнитное поле парамагнетик намагничивается, создавая собственное магнитное поле, совпадающее по направлению с внешним полем и усиливающее его. (напр., Pt, Al, O 2 )
Изображение слайда
21
Слайд 21: Магнитное поле в веществе
Вектор магнитной индукций результирующего поля в магнетике — магнитная индукция внешнего поля -магнитная индукция внутреннего поля (поля, создаваемого микротоками) Микротоки – токи, обусловленные движением электронов в атомах, ионах и молекулах. — намагниченность
Изображение слайда
22
Слайд 22: Связь между векторами и
– магнитная восприимчивость вещества – безразмерная величина Эта линейная зависимость между намагниченностью и напряженностью поля, вызывающего намагничение, соблюдается в случае несильных полей. – для диамагнетиков (поле микротоков противоположно внешнему) – для парамагнетиков (поле микротоков совпадает с внешним)
Изображение слайда
23
Слайд 23: Магнитное поле в веществе
( получается после подстановки в ) (Это выражение постулировалось ранее, см. лекция 5) относительная магнитная проницаемость вещества
Изображение слайда
24
Слайд 24: Теорема о циркуляции вектора в веществе
– алгебраическая сумма токов проводимости ( макротоков ), охватываемых контуром – алгебраическая сумма микротоков, охватываемых контуром
Изображение слайда
25
Слайд 25: Теорема о циркуляции вектора
– алгебраическая сумма микротоков, охватываемых контуром
Изображение слайда
26
Слайд 26: Теорема о циркуляции вектора
– алгебраическая сумма токов проводимости ( макротоков ), охватываемых контуром
Изображение слайда
27
Слайд 27: Условия для магнитного поля на границе раздела двух магнетиков
B 1 2 1 2 B 1 B 2 B n B ( если макротоки не идут по поверхности раздела сред)
Изображение слайда
28
Слайд 28: Ферромагнетики
— вещества, обладающие при не слишком высоких температурах самопроизвольной (спонтанной) намагниченностью, которая сильно изменяется под влиянием внешних воздействий – магнитного поля, деформации, изменения температуры.
Изображение слайда
29
Слайд 29: Зависимость намагниченности намагниченности от напряженности магнитного поля для слабо- и сильномагнитных веществ
Диа — и парамагнетики – слабомагнитные вещества. Ферромагнетики – сильномагнитные вещества.
Изображение слайда
30
Слайд 30: Магнитный гистерезис
В В В В ос В нас Пусть ферромагнетик предварительно полностью размагничен. Тогда во внешнем магн. поле В возрастает по начальной кривой намагничивания до состояния магнитного насыщения. В ос – остаточная магнитная индукция — коэрцитивная сила
Изображение слайда
31
Последний слайд презентации: Сравнение теорем о циркуляции векторов и: Зависимость магнитной проницаемости ферромагнетика от напряженности магнитного поля
Изображение слайда
Операторы отношения и их функции MatLab
Арифметические операторы и функции
Операторы отношения и их функции
Логические операторы
Специальные символы
Системные переменные и константы
Функции поразрядной обработки
Функции обработки множеств
Функции времени и даты
Элементарные функции
Алгебраические и арифметические функции
Тригонометрические и обратные им функции
Гиперболические и обратные им функции
Функции округления и знака
Функции комплексного аргумента
Что нового мы узнали?
Операторы отношения служат для сравнения двух величин, векторов или матриц. Все операторы отношения имеют два операнда, например х и у, и записываются, как показано в табл. 8.2.
Таблица 8.2. Операторы и функции отношения
Функция | Название | Оператор | Пример |
Eq | Равно | = = | x = = y |
Ne | He равно | ~ = | x ~ = y |
Lt | Меньше чем | < | x<y |
Gt | Больше чем | > | x>y |
Le | Меньше или равно | <= | x<=y |
Ge | Больше или равно | >= | x>=y |
Данные операторы выполняют поэлементное сравнение векторов или матриц одинакового размера и возвращают значение 1 (True), если элементы идентичны, и значение 0 (False) в противном случае. Если операнды — действительные числа, то применение операторов отношения тривиально:
» eq(2.2)
ans =
1
» 2==2
ans =
1
» ne(l,2)
ans =
1
» 2 ~- 2
ans =
0
» 5 > 3
ans =
1
» le(5.3)
ans =
0
Следует отметить, что операторы <, <=, > и >= при комплексных операндах используют для сравнения только действительные части операндов — мнимые отбрасываются. В то же время операторы == и ~= ведут сравнение с учетом как действительной, так и мнимой частей операндов. Следующие примеры поясняют это положение:
» (2+3i)>-(2+i)
ans=
1
» (2+3i)>(2+i)
ans=
0
» abs(2+3i)>abs(2+i)
ans =
1
» (2+3i)—(2+i)
ans =
0
» (2+3i)-(2+i)
ans =
1
Если один из операндов — скаляр, происходит сравнение всех элементов второго операнда-массива со значением этого скаляра:
M=
-1 0
1 2
» М>=0
ans =
0 1
1 1
В общем случае операторы отношения сравнивают два массива одного размера и выдают результат в виде массива того же размера:
» М>[0 1;.1 0]
ans
=
0 0
0 1
Таким образом, спектр применения операторов отношения в системе MATLAB шире, чем в обычных языках программирования, поскольку операндами являются не только числа, но и векторы, матрицы и массивы. Возможно применение операторов отношения и к символьным выражениям:
» ‘b’>’а’
ans =
1
» ‘abc’= =’abc’
ans =
1 1 1
» ‘cba'<‘abc’
ans =
0 0 1
В этом случае символы, входящие в выражения, представляются своими ASCII-кодами. Строки воспринимаются как векторы, содержащие значения кодов. Все это надо учитывать при использовании управляющих структур языка программирования, в которых широко применяются операторы отношения.
Быстрая проверка, содержат ли два вектора STL одинаковые элементы или нет.
В отличие от обычных массивов C / C ++, нам не нужно проводить поэлементное сравнение, чтобы определить, содержат ли два заданных вектора одинаковые элементы или нет.
В случае векторов оператор «==» перегружен, чтобы быстро найти результат. Ниже приведен пример, демонстрирующий то же самое.
C ++ 14
|
Выход:
Равно Не равный Не равный Равно
Автор статьи: Sachin Bisht .Если вам нравится GeeksforGeeks и вы хотите внести свой вклад, вы также можете написать статью, используя write.geeksforgeeks.org, или отправить свою статью по адресу [email protected]. Посмотрите, как ваша статья появляется на главной странице GeeksforGeeks, и помогите другим гикам.
Пожалуйста, напишите комментарий, если вы обнаружите что-то неправильное, или если вы хотите поделиться дополнительной информацией по теме, обсужденной выше.
Функции сравнения векторов - приложения Win32
- 2 минуты на чтение
В этой статье
Перечисляет функции сравнения векторов.
В этом разделе
Тема | Описание |
---|---|
XMVectorEqual | Выполняет покомпонентный тест на равенство двух векторов. |
XMVectorEqualInt | Выполняет покомпонентный тест на равенство двух векторов, обрабатывая каждый компонент как целое число без знака. |
XMVectorEqualIntR | Выполняет покомпонентный тест на равенство двух векторов, обрабатывая каждый компонент как целое число без знака.Кроме того, эта функция устанавливает значение для сравнения, которое можно проверить с помощью таких функций, как XMComparisonAllTrue . |
XMVectorEqualR | Выполняет покомпонентный тест на равенство двух векторов и устанавливает значение сравнения, которое можно проверить с помощью таких функций, как XMComparisonAllTrue . |
XMVectorGreater | Выполняет покомпонентный тест на наличие большего, чем между двумя векторами. |
XMVectorGreaterOrEqual | Выполняет покомпонентный тест на наличие большего или равного между двумя векторами. |
XMVectorGreaterOrEqualR | Выполняет покомпонентный тест на наличие большего или равного между двумя векторами и устанавливает значение сравнения, которое можно проверить с помощью таких функций, как XMComparisonAllTrue . |
XMVectorGreaterR | Выполняет покомпонентный тест на наличие большего количества векторов и устанавливает значение сравнения, которое можно проверить с помощью таких функций, как XMComparisonAllTrue . |
XM Без вектора | Выполняет покомпонентный тест на наличие меньше чем двух векторов. |
XMVectorLessOrEqual | Выполняет покомпонентный тест на наличие «меньше или равно» между двумя векторами. |
XMVectorNearEqual | Выполняет покомпонентный тест на равенство двух векторов в пределах заданного порога. |
Векторные функции библиотеки DirectXMath
Сравнение переносчиков биотипов Aedes vexans Green River и Culex pipiens pipiens для линий 1 и 2 вируса Западного Нила
.2020 июн; 67 (4): 416-424. DOI: 10.1111 / zph.12700. Epub 2020 12 марта.Принадлежности Расширять
Принадлежности
- 1 Лаборатория переносчиков инфекций, Институт инфектологии, Институт Фридриха Леффлера, Грайфсвальд, Германия.
- 2 Институт новых и возникающих инфекционных заболеваний, Институт Фридриха Леффлера, Грайфсвальд, Германия.
- 3 Лаборатория взаимодействия молекулярных векторов и патогенов, Институт инфектологии, Институт Фридриха Леффлера, Грайфсвальд, Германия.
- 4 Университет Грайфсвальда, Грайфсвальд, Германия.
Элемент в буфере обмена
Элизабет Венке и др.Зоонозы в области общественного здравоохранения. 2020 июн.
Показать детали Показать вариантыПоказать варианты
Формат АннотацияPubMedPMID
.2020 июн; 67 (4): 416-424. DOI: 10.1111 / zph.12700. Epub 2020 12 марта.Принадлежности
- 1 Лаборатория переносчиков инфекций, Институт инфектологии, Институт Фридриха Леффлера, Грайфсвальд, Германия.
- 2 Институт новых и возникающих инфекционных заболеваний, Институт Фридриха Леффлера, Грайфсвальд, Германия.
- 3 Лаборатория взаимодействия молекулярных векторов и патогенов, Институт инфектологии, Институт Фридриха Леффлера, Грайфсвальд, Германия.
- 4 Университет Грайфсвальда, Грайфсвальд, Германия.
Элемент в буфере обмена
Полнотекстовые ссылки Опции CiteDisplayПоказать варианты
Формат АннотацияPubMedPMID
Абстрактный
Вирус Западного Нила (ВЗН), зоонозный арбовирус, недавно установил цикл автохтонной передачи в Германии.У тупиковых хозяев, таких как люди и лошади, инфекция ЛЗН может вызывать серьезные симптомы в центральной нервной системе. В природе WNV поддерживается в энзоотическом цикле передачи между птицами и орнитофильными комарами. Виды переносчиков-мостиков, такие как члены комплекса Culex pipiens и Aedes spp., Также широко распространенные в Германии, могут передавать ЛЗН другим позвоночным видам-хозяевам. Это исследование определило и сравнило векторную компетенцию собранных в полевых условиях Cx из северной Германии. pipiens, биотип pipiens, и Ae, разводимые в лаборатории.vexans Green River (GR) для линии WNV 1 (штамм: Magpie / Италия / 203204) и линии WNV 2 (штамм: «Австрия») при температурах, типичных для северной Германии весной / летом и осенью. Для оценки переносчиков инфекции самкам комаров в возрасте от 7 до 14 дней предлагали WNV, содержащую кровяную муку, через мембранную систему кормления Hemotek или кормление ватными палочками. После инкубации при 18 ° C или 24 ° C в течение 14 дней налитые самки комаров выделяли слюну и анализировали для определения скорости распространения инфекции, распространения и передачи с помощью количественной ПЦР с обратной транскриптазой в реальном времени (RT-qPCR).Оба Ae. vexans GR и Cx. pipiens biotype pipiens были инфицированы обоими протестированными штаммами WNV и протестированы через 14 дней после инокуляции. Диссеминированные инфекции обнаружены только у Ae. vexans GR инкубировали при 18 ° C и в Cx. pipiens pipiens инкубировали при 24 ° C после заражения линией 1 WNV. Передача линии 1 WNV была обнаружена в Сх. pipiens pipiens инкубируют при 24 ° C. Эти результаты показывают, что Cx. pipiens pipiens из Северной Германии может быть вовлечен в передачу WNV, в том числе тупиковым хозяевам, таким как люди и лошади.
Ключевые слова: Aedes vexans; Culex pipiens pipiens; Вирус Западного Нила; вектор компетентности.
© 2020 Blackwell Verlag GmbH.
Похожие статьи
- Вирус Западного Нила, линия происхождения 2, переносимость местных комаров Culex и Aedes из Германии в умеренных климатических условиях.
Holicki CM, Ziegler U, Răileanu C, Kampen H, Werner D, Schulz J, Silaghi C, Groschup MH, Vasić A. Holicki CM, et al. Вирусы. 2020 19 мая; 12 (5): 561. DOI: 10.3390 / v12050561. Вирусы. 2020. PMID: 32438619 Бесплатная статья PMC.
- Влияние перезимовки на выживаемость и переносимость переносчика вируса Западного Нила Culex pipiens.
Koenraadt CJM, Möhlmann TWR, Verhulst NO, Spitzen J, Vogels CBF.Koenraadt CJM и др. Векторы паразитов. 2019 27 марта; 12 (1): 147. DOI: 10.1186 / s13071-019-3400-4. Векторы паразитов. 2019. PMID: 30917854 Бесплатная статья PMC.
- Компетентность Aedes vexans (Diptera: Culicidae) в качестве переносчика вируса Западного Нила и потенциал в качестве энзоотического переносчика.
Тиавсирисуп С., Кинли Дж. Р., Такер Б. Дж., Эванс Р. Б., Роули В. А., Платт КБ. Tiawsirisup S и др.J Med Entomol. 2008 Май; 45 (3): 452-7. DOI: 10.1603 / 0022-2585 (2008) 45 [452: VCOAVD] 2.0.CO; 2. J Med Entomol. 2008 г. PMID: 18533439
- Вклад комаров комплекса Culex pipiens в передачу и сохранение вируса Западного Нила в Северной Америке.
Андредис Т.Г. Андредис Т.Г. J Am Mosq Control Assoc. 2012 декабрь; 28 (4 доп.): 137-51. DOI: 10.2987 / 8756-971Х-28.4с.137. J Am Mosq Control Assoc. 2012 г. PMID: 23401954 Рассмотрение.
- Возможная передача вируса Западного Нила на Британских островах: экологический обзор возможных переносчиков москитного моста.
Медлок Дж. М., Сноу К. Р., Лич С. Medlock JM и др. Med Vet Entomol. 2005 Март; 19 (1): 2-21. DOI: 10.1111 / j.0269-283X.2005.00547.x. Med Vet Entomol.2005 г. PMID: 15752172 Рассмотрение.
использованная литература
ССЫЛКИ
- Альтшул, С. Ф., Гиш, В., Миллер, В., Майерс, Э. В., и Липман, Д. Дж. (1990). Базовый инструмент поиска локального выравнивания. Журнал молекулярной биологии, 215 (3), 403-410. https://doi.org/10.1016 / S0022-2836 (05) 80360-2
- Бакони, Т., Иваникс, Э., Эрдейи, К., Урсу, К., Ференци, Э., Вайссенбек, Х., и Новотны, Н. (2006). Штаммы линии 1 и 2 энцефалита вируса Западного Нила, Центральная Европа. Новые инфекционные заболевания, 12 (4), 619-623.
- Барзон Л., Папа А., Лавеццо, Э., Франчин, Э., Паченти, М., Синигалья, А.,… Пале, Г. (2015). Филогенетическая характеристика вируса Западного Нила в Центральной / Южной Европе Lineage 2: Анализ вспышек заболеваний среди людей в Италии и Греции, 2013-2014 гг. Клиническая микробиология и инфекция, 21, 1121.e1-1122.e10.
- Бек, К., Хименес-Клаверо, М. А., Леблон, А., Дюран, Б., Новотны, Н., Лепаре-Гоффарт, И.,… Леколлине, С.(2013). Флавивирусы в Европе: сложные модели циркуляции и их последствия для диагностики и борьбы с болезнью Западного Нила. Международный журнал исследований окружающей среды и общественного здравоохранения, 10, 6049-6083. https://doi.org/10.3390/ijerph20116049
- Беккер, Н., Крюгер, А., Кун, К., Пленге-Бениг, А., Томас, С. М., Шмидт-Чаназит, Дж., И Танних, Э. (2014). Stechmücken как Übertrager exotischer Krankheitserreger в Германии.Bundesgesundheitsbl, 57, 531-540 (статья на немецком языке). https://doi.org/10.1007/s00103-013-1918-8
Показать все 38 ссылок
Условия MeSH
- Взаимодействие хозяин-патоген
- Переносчики комаров / вирусология *
- Вирус Западного Нила / классификация *
- Вирус Западного Нила / физиология *
LinkOut - дополнительные ресурсы
Источники полного текста
Разное
цитировать
КопироватьФормат: AMA APA ГНД NLM
runtime analysis - Сложность сравнения векторов
Вопрос по SO о сложности сортировки векторов векторов заставил меня задуматься о сложности сравнения двух векторов.64 значения ) гораздо более вероятно, что он завершит сравнение раньше, чем, скажем, вектор единиц и нулей (область 2 значения
).
Пусть M
будет размером домена (количество значений, которые может содержать каждый элемент; размер алфавита)
Теперь, когда мы принимаем во внимание, что M
является фиксированным (а это так), у нас может возникнуть соблазн сказать, что сложность все еще равна O (N)
, независимо от того, насколько велик M
. Он может иметь очень маленький коэффициент O (f * N)
, но все равно O (N)
.32 ) потребуется 16 гига
. Поэтому я бы сказал, что можно с уверенностью предположить, что 2) , что N
(для меня интуитивно это означает, что временная сложность не имеет шанса «взорваться» из-за очень малого фактора и потому что N не имеет возможности стать достаточно большим - по сравнению с M)
Итак, учитывая N
) мы можем пересчитать сложность сравнения векторов до значения ниже O (N)
?
Или я далеко?
1) размер вектора = количество элементов (не размер в байтах)
2) для векторов с большими целыми числами и для большинства реальных применений (полностью игнорируя редкие приложения, которые имеют дело с очень-очень большими векторами)
дополнительно) Я думаю, само собой разумеется, что сравнение элементов - это O (1)
Сравнение методов получения AAV-вектора для генной терапии и доклинической оценки
Tratschin, J. D., West, M. H., Sandbank, T. & Carter, B. J. Парвовирус человека, аденоассоциированный вирус, в качестве эукариотического вектора: временная экспрессия и инкапсидация прокариотического гена хлорамфениколацетилтрансферазы. Мол. Клетка. Биол. 4 , 2072–2081. https://doi.org/10.1128/mcb.4.10.2072 (1984).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Хермонат, П.L. & Muzyczka, N. Использование аденоассоциированного вируса в качестве вектора для клонирования ДНК млекопитающих: трансдукция устойчивости к неомицину в клетки культуры ткани млекопитающих. Proc. Natl. Акад. Sci. США 81 , 6466–6470. https://doi.org/10.1073/pnas.81.20.6466 (1984).
ADS CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Григер, Дж. К. и Самульски, Р. Дж. Аденоассоциированный вирус как вектор генной терапии: разработка вектора, производство и клиническое применение. Adv. Biochem. Англ. Biotechnol. 99 , 119–145 (2005).
CAS PubMed Google ученый
Gray, S. J. et al. Производство рекомбинантных аденоассоциированных вирусных векторов и применение in vitro и in vivo. Curr. Protoc. Neurosci. DOI: https: //doi.org/10.1002/0471142301.ns0417s57 (2011).
Картер Б. Дж. Аденоассоциированный вирус и разработка аденоассоциированных вирусных векторов: историческая перспектива. Мол. Ther. 10 , 981–989. https://doi.org/10.1016/j.ymthe.2004.09.011 (2004).
CAS Статья PubMed Google ученый
Хасти, Э. и Самульски, Р. Дж. 50 лет аденоассоциированному вирусу: золотая годовщина открытия, исследования и успеха генной терапии - личная точка зрения. Гум. Gene Ther. 26 , 257–265. https://doi.org/10.1089/hum.2015.025 (2015).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Heuer, A., Kirkeby, A., Pfisterer, U., Jonsson, M. E. и Parmar, M. Нейронные предшественники, полученные из hESC, предотвращают отторжение ксенотрансплантата посредством неонатальной десенсибилизации. Exp. Neurol. 282 , 78–85. https://doi.org/10.1016/j.expneurol.2016.05.027 (2016).
Артикул PubMed PubMed Central Google ученый
Masamizu, Y. et al. Локальный и ретроградный перенос генов в нейрональные пути приматов через аденоассоциированный вирус серотипов 8 и 9. Неврология 193 , 249–258. https://doi.org/10.1016/j.neuroscience.2011.06.080 (2011).
CAS Статья PubMed Google ученый
Tervo, D. G. et al. Дизайнерский вариант AAV обеспечивает эффективный ретроградный доступ к проекционным нейронам. Нейрон 92 , 372–382. https://doi.org/10.1016/j.neuron.2016.09.021 (2016).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Davidsson, M. et al. Систематический подход к эволюции капсида, применяемый in vivo для создания векторов AAV с заданными свойствами и тропизмом. Proc. Natl. Акад. Sci. США https://doi.org/10.1073/pnas.11116 (2019).
Артикул PubMed PubMed Central Google ученый
Aldrin-Kirk, P. et al. Хемогенетическая модуляция холинергических интернейронов показывает их регулирующую роль в прямых и косвенных путях выхода из полосатого тела. Neurobiol. Дис. 109 , 148–162. https://doi.org/10.1016/j.nbd.2017.10.010 (2018).
CAS Статья PubMed Google ученый
Aldrin-Kirk, P. et al. Модуляция DREADD трансплантированных нейронов DA выявляет новый механизм паркинсонической дискинезии, опосредованный рецептором серотонина 5-HT6. Нейрон 90 , 955–968. https://doi.org/10.1016/j.neuron.2016.04.017 (2016).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Mateo, C. et al. Оптогенетическая стимуляция возбуждающих нейронов неокортекса in vivo приводит к ингибированию, зависящему от состояния мозга. Curr. Биол. 21 , 1593–1602. https://doi.org/10.1016/j.cub.2011.08.028 (2011).
ADS CAS Статья PubMed Google ученый
Gradinaru, V. et al. Молекулярные и клеточные подходы для диверсификации и расширения оптогенетики. Ячейка 141 , 154–165. https://doi.org/10.1016/j.cell.2010.02.037 (2010).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Gunaydin, L.A. et al. Сверхбыстрый оптогенетический контроль. Нат. Neurosci. 13 , 387–392. https: // doi.org / 10.1038 / nn.2495 (2010).
CAS Статья PubMed Google ученый
Ran, F. A. et al. Редактирование генома in vivo с использованием Staphylococcus aureus Cas9. Природа 520 , 186–191. https://doi.org/10.1038/nature14299 (2015).
ADS CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Swiech, L. et al. Исследование функции гена в мозге млекопитающих in vivo с использованием CRISPR-Cas9. Нат. Biotechnol. 33 , 102–106. https://doi.org/10.1038/nbt.3055 (2015).
CAS Статья PubMed Google ученый
Cox, D. B. T. et al. Редактирование РНК с помощью CRISPR-Cas13. Наука 358 , 1019–1027. https://doi.org/10.1126/science.aaq0180 (2017).
ADS CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Senis, E. et al. CRISPR / Cas9-опосредованная геномная инженерия: набор инструментов для вектора аденоассоциированного вируса (AAV). Biotechnol. J. 9 , 1402–1412. https://doi.org/10.1002/biot.201400046 (2014).
CAS Статья PubMed Google ученый
Борел, Ф., Кей, М. А. и Мюллер, С. Рекомбинантный AAV как платформа для трансляции терапевтического потенциала РНК-интерференции. Мол.Ther. 22 , 692–701. https://doi.org/10.1038/mt.2013.285 (2014).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Keeler, A. M. et al. Клеточный анализ подавления гена болезни Хантингтона с использованием AAV9-опосредованной доставки искусственной микроРНК в полосатое тело мышей Q140 / Q140. J. Huntingtons Dis. 5 , 239–248. https://doi.org/10.3233 / JHD-160215 (2016).
CAS Статья PubMed Google ученый
Pfister, E. L. et al. Искусственные миРНК снижают человеческий мутантный гентингтин в полосатом теле у трансгенной овцы, моделирующей болезнь Хантингтона. Гум. Gene Ther. 29 , 663–673. https://doi.org/10.1089/hum.2017.199 (2018).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Thakore, P. I. et al. РНК-управляемое подавление транскрипции in vivo с репрессорами CRISPR-Cas9 S. aureus. Nat Commun 9 , 1674. DOI: https: //doi.org/10.1038/s41467-018-04048-4 (2018).
Abudayyeh, O.O. et al. Нацеливание на РНК с помощью CRISPR-Cas13. Природа 550 , 280–284. https://doi.org/10.1038/nature24049 (2017).
ADS CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Атчисон Р. В., Касто Б. С. и Хэммон В. М. Дефектные вирусные частицы, ассоциированные с аденовирусом. Наука 149 , 754–756. https://doi.org/10.1126/science.149.3685.754 (1965).
ADS CAS Статья PubMed Google ученый
Pillay, S. et al. Важный рецептор аденоассоциированной вирусной инфекции. Природа 530 , 108–112. https: // doi.org / 10.1038 / nature16465 (2016).
ADS CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Srivastava, A., Lusby, E. W. & Berns, K. I. Нуклеотидная последовательность и организация генома аденоассоциированного вируса 2. J. Virol. 45 , 555–564 (1983).
CAS Статья Google ученый
Чу, Ю., Бартус, Р. Т., Манфредссон, Ф. П., Оланов, К. В. и Кордовер, Дж. Х. Долгосрочные патологоанатомические исследования после генной терапии нейртурином у пациентов с поздней стадией болезни Паркинсона. Мозг 143 , 960–975. https://doi.org/10.1093/brain/awaa020 (2020).
Артикул PubMed PubMed Central Google ученый
Грей С. Дж., Вудард К. Т. и Самульски Р. Дж. Вирусные векторы и стратегии доставки для генной терапии ЦНС. Ther. Deliv. 1 , 517–534. https://doi.org/10.4155/tde.10.50 (2010).
CAS Статья PubMed Google ученый
Wong, L. F. et al. Перенос генов, опосредованный лентивирусами, в центральную нервную систему: терапевтические и исследовательские применения. Гум. Gene Ther. 17 , 1–9. https://doi.org/10.1089/hum.2006.17.1 (2006).
MathSciNet CAS Статья PubMed Google ученый
Ховард, Д. Б., Пауэрс, К., Ван, Ю. и Харви, Б. К. Тропизм и токсичность аденоассоциированных вирусных векторов серотипов 1, 2, 5, 6, 7, 8 и 9 в нейронах и глии крыс in vitro. Вирусология 372 , 24–34. https://doi.org/10.1016/j.virol.2007.10.007 (2008).
CAS Статья PubMed Google ученый
Taymans, J. M. et al. Сравнительный анализ аденоассоциированных вирусных векторов серотипов 1, 2, 5, 7 и 8 в мозге мышей. Гум. Gene Ther. 18 , 195–206. https://doi.org/10.1089/hum.2006.178 (2007).
CAS Статья PubMed Google ученый
Маккарти, Д. М., Монахан, П. Э. и Самульски, Р. Дж. Самокомплементарные векторы рекомбинантного аденоассоциированного вируса (scAAV) способствуют эффективной трансдукции независимо от синтеза ДНК. Gene Ther. 8 , 1248–1254. https://doi.org/10.1038/sj.gt.3301514 (2001).
CAS Статья PubMed Google ученый
Deverman, B.E. et al. Cre-зависимый отбор дает варианты AAV для широко распространенного переноса генов во взрослый мозг. Нат. Biotechnol. 34 , 204–209. https://doi.org/10.1038/nbt.3440 (2016).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Chan, K. Y. et al. Разработаны AAV для эффективной неинвазивной доставки генов в центральную и периферическую нервную систему. Нат. Neurosci. 20 , 1172–1179. https://doi.org/10.1038/nn.4593 (2017).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Zingg, B. et al. AAV-опосредованная антероградная транссинаптическая маркировка: картирование нейронных путей, определяемых кортикоколликулярным входом, для защитного поведения. Нейрон 93 , 33–47. https://doi.org/10.1016/j.neuron.2016.11.045 (2017).
CAS Статья PubMed Google ученый
Borner, K. et al. Предварительно расставленные библиотеки для отображения пептидов Pan-AAV для быстрого однократного скрининга. Мол. Ther. 28 , 1016–1032. https://doi.org/10.1016/j.ymthe.2020.02.009 (2020).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Канаан, Н. М. и др. Рационально разработанные капсиды AAV улучшают трансдукцию и объемное распространение в ЦНС. Мол. Ther. Нуклеиновые кислоты 8 , 184–197. https://doi.org/10.1016/j.omtn.2017.06.011 (2017).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Гаспар, Х. Б., Хоу, С. и Трэшер, А. Дж. Прогресс и перспективы генной терапии: генная терапия тяжелого комбинированного иммунодефицита. Gene Ther. 10 , 1999–2004 гг. https://doi.org/10.1038/sj.gt.3302150 (2003).
CAS Статья PubMed Google ученый
Jacobson, S. G. et al. Улучшение и снижение зрения с помощью генной терапии детской слепоты. N. Engl. J. Med. 372 , 1920–1926 гг. https://doi.org/10.1056/NEJMoa1412965 (2015).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Сан, Дж. Ю., Ананд-Джава, В., Чаттерджи, С. и Вонг, К. К. Иммунные ответы на аденоассоциированный вирус и его рекомбинантные векторы. Gene Ther. 10 , 964–976. https://doi.org/10.1038/sj.gt.3302039 (2003).
CAS Статья PubMed Google ученый
Хасти Э. и Самульски Р. Дж. Рекомбинантные аденоассоциированные вирусные векторы в лечении редких заболеваний. Мнение эксперта. Орфанные препараты 3 , 675–689.https://doi.org/10.1517/21678707.2015.1039511 (2015).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Гинн, С. Л., Амайя, А. К., Александр, И. Е., Эдельштейн, М. и Абеди, М. Р. Клинические испытания генной терапии во всем мире до 2017 г .: обновленная информация. J. Gene Med. 20 , e3015. https://doi.org/10.1002/jgm.3015 (2018).
Артикул PubMed Google ученый
Мюллер К. и Флотт Т. Р. Клиническая генная терапия с использованием рекомбинантных аденоассоциированных вирусных векторов. Gene Ther. 15 , 858–863. https://doi.org/10.1038/gt.2008.68 (2008).
CAS Статья PubMed Google ученый
Maguire, A. M. et al. Безопасность и эффективность переноса генов при врожденном амаврозе Лебера. N. Engl. J. Med. 358 , 2240–2248.https://doi.org/10.1056/NEJMoa0802315 (2008).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Maguire, A. M. et al. Эффективность, безопасность и стойкость воретигена Neparvovec-rzyl при наследственной дистрофии сетчатки, связанной с мутацией RPE65: результаты фаз 1 и 3 испытаний. Офтальмология 126 , 1273–1285. https://doi.org/10.1016/j.ophtha.2019.06.017 (2019).
Артикул PubMed Google ученый
Russell, S. et al. Эффективность и безопасность воретигена непарвовека (AAV2-hRPE65v2) у пациентов с наследственной дистрофией сетчатки, опосредованной RPE65: рандомизированное контролируемое открытое исследование фазы 3. Ланцет 390 , 849–860. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(17)31868-8 (2017).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Бэтти П. и Лилликрэп Д. Достижения и проблемы генной терапии гемофилии. Гум. Мол. Genet. 28 , R95 – R101. https://doi.org/10.1093/hmg/ddz157 (2019).
CAS Статья PubMed Google ученый
Mendell, J. R. et al. Однодозная генно-заместительная терапия при мышечной атрофии позвоночника. N. Engl. J. Med. 377 , 1713–1722. https://doi.org/10.1056/NEJMoa1706198 (2017).
CAS Статья PubMed Google ученый
Hocquemiller, M., Giersch, L., Audrain, M., Parker, S. & Cartier, N. Генная терапия заболеваний ЦНС на основе аденоассоциированного вируса. Гум. Gene Ther. 27 , 478–496. https://doi.org/10.1089/hum.2016.087 (2016).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Negrini, M., Wang, G., Heuer, A., Bjorklund, T. & Davidsson, M. Производство AAV повсюду: простой, быстрый и надежный протокол для собственного производства векторов AAV на основе хлороформа добыча. Curr. Prot. Neurosci. https://doi.org/10.1002/cpns.103 (2020).
Артикул Google ученый
Xiaobing, W. et al. Новый метод крупномасштабной очистки рекомбинантных аденоассоциированных вирусных векторов. Подбородок. Sci. Бык. 46 , 485–488 (2001).
Google ученый
Сандовал И. М., Кун Н.М. и Манфредссон, Ф. П. Мультимодальное производство аденоассоциированного вируса. Methods Mol. Биол. 101–124 , 2019. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-9065-8_6 (1937).
CAS Статья Google ученый
Золотухин, С. и др. Очистка рекомбинантного аденоассоциированного вируса с использованием новых методов улучшает инфекционный титр и урожайность. Gene Ther. 6 , 973–985.https://doi.org/10.1038/sj.gt.3300938 (1999).
CAS Статья PubMed Google ученый
Бенски, М. Дж., Сандовал, И. М. и Манфредссон, Ф. П. Непрерывный сбор аденоассоциированного вируса из среды клеток-продуцентов значительно увеличивает общий выход вируса. Гум. Gene Ther. Методы 27 , 32–45. https://doi.org/10.1089/hgtb.2015.117 (2016).
CAS Статья PubMed Google ученый
Hindson, B.J. et al. Высокопроизводительная система цифровой ПЦР по каплям для абсолютного количественного определения количества копий ДНК. Анал. Chem. 83 , 8604–8610. https://doi.org/10.1021/ac202028g (2011 г.).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Heuer, A., Lelos, M.J., Kelly, C.M., Torres, E.M. & Dunnett, S.B. Богатые дофамином трансплантаты уменьшают дефицит контралатерального пространства ответа, вызванный обширным истощением дофамина у крыс. Exp. Neurol. 247 , 485–495. https://doi.org/10.1016/j.expneurol.2013.01.020 (2013).
CAS Статья PubMed Google ученый
Torres, E. M. & Dunnett, S. B. Вызванное амфетамином чередование при оценке поражений и трансплантатов в односторонней модели болезни Паркинсона на крысах. Eur. Neuropsychopharmacol. 17 , 206–214. https://doi.org/10.1016/j.euroneuro.2006.04.009 (2007).
CAS Статья PubMed Google ученый
Ungerstedt, U. & Arbuthnott, G. W. Количественная регистрация ротационного поведения у крыс после 6-гидроксидофаминовых повреждений нигростриатальной дофаминовой системы. Brain Res. 24 , 485–493. https://doi.org/10.1016/0006-8993(70)-3 (1970).
CAS Статья PubMed Google ученый
Ungerstedt, U., Butcher, L.L., Butcher, S.G., Anden, N.E. & Fuxe, K. Прямая химическая стимуляция дофаминергических механизмов в неостриатуме крысы. Brain Res. 14 , 461–471. https://doi.org/10.1016/0006-8993(69)-x (1969).
CAS Статья PubMed Google ученый
Lockowandt, M. et al. Оптимизация продукции и экспрессии трансгена ретроградно транспортируемого псевдотипированного лентивирусного вектора. J. Neurosci. Методы 336 , 108542. https://doi.org/10.1016/j.jneumeth.2019.108542 (2020).
CAS Статья PubMed Google ученый
Heuer, A., Smith, G.A. & Dunnett, S. B. Сравнение 6-гидроксидофаминовых поражений черной субстанции и медиального пучка переднего мозга в задаче латерализованного выбора времени реакции у мышей. Eur. J. Neurosci. 37 , 294–302. https: // doi.org / 10.1111 / ejn.12036 (2013).
Артикул PubMed Google ученый
Буллер Р. М. и Роуз Дж. А. Характеристика аденовирус-ассоциированных вирусных полипептидов в клетках KB. J. Virol. 25 , 331–338. https://doi.org/10.1128/JVI.25.1.331-338.1978 (1978).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Бьорклунд, А. и Даннет, С. Б. Тест на вращение, вызванное амфетамином: переоценка его использования в качестве инструмента для мониторинга двигательных нарушений и функционального восстановления на моделях болезни Паркинсона на грызунах. J.Parkinsons Dis. 9 , 17–29. https://doi.org/10.3233/JPD-181525 (2019).
Артикул PubMed PubMed Central Google ученый
Nayak, S. & Herzog, R. W. Прогресс и перспективы: иммунные ответы на вирусные векторы. Gene Ther. 17 , 295–304. https://doi.org/10.1038/gt.2009.148 (2010).
CAS Статья PubMed Google ученый
Ласаро, М. О. и Эртл, Х. С. Новые взгляды на аденовирус как вектор вакцины. Мол. Ther. 17 , 1333–1339. https://doi.org/10.1038/mt.2009.130 (2009).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Рабиновиц, Дж., Чан, Ю. К. и Самульски, Р. Дж. Аденоассоциированный вирус (AAV) в сравнении с иммунным ответом. Вирусы 11 , 1. https://doi.org/10.3390/v11020102 (2019).
CAS Статья Google ученый
Вэнс, М. А., Митчелл, А. и Самульски, Р. Дж. В статье Генная терапия - принципы и проблемы (изд. Доаа Хашад) (Intech, 2015).
Ojala, D. S. et al. Выбор in vivo компьютерно сконструированной библиотеки SCHEMA AAV дает новый вариант инфицирования взрослых нервных стволовых клеток в SVZ. Мол. Ther. 26 , 304–319. https://doi.org/10.1016/j.ymthe.2017.09.006 (2018).
CAS Статья PubMed Google ученый
Ellis, B. L. et al. Обзор эффективности трансдукции ex vivo / in vitro первичных клеток и клеточных линий млекопитающих с использованием девяти природных аденоассоциированных вирусов (AAV1-9) и одного серотипа сконструированного аденоассоциированного вируса. Virol. J. 10 , 74. https://doi.org/10.1186/1743-422X-10-74 (2013).
Артикул PubMed PubMed Central Google ученый
Кирик Д., Розенблад С. и Бьорклунд А. Характеристика поведенческих и нейродегенеративных изменений после частичных повреждений нигростриатальной дофаминовой системы, вызванных интрастриатальным введением 6-гидроксидопамина у крыс. Exp. Neurol. 152 , 259–277.https://doi.org/10.1006/exnr.1998.6848 (1998).
CAS Статья PubMed Google ученый
Ландек Н., Бак К. и Кирик Д. Токсические эффекты вариантов альфа-синуклеина у человека и грызунов in vivo. Eur. J. Neurosci. 45 , 536–547. https://doi.org/10.1111/ejn.13493 (2017).
Артикул PubMed Google ученый
Мингоцци, Ф. и Хай, К. А. Иммунные ответы на векторы AAV: преодоление препятствий на пути к успешной генной терапии. Кровь 122 , 23–36. https://doi.org/10.1182/blood-2013-01-306647 (2013).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Ронзитти Г., Гросс Д. А. и Мингоцци Ф. Иммунные ответы человека на векторы аденоассоциированного вируса (AAV). Фронт. Иммунол. 11 , 670. https://doi.org/10.3389/fimmu.2020.00670 (2020).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Di Maria, V. et al. Разработка и проверка систем активаторов CRISPR для сверхэкспрессии рецепторов CB1 в нейронах. Фронт. Мол. Neurosci. 13 , 168. https://doi.org/10.3389/fnmol.2020.00168 (2020).
CAS Статья PubMed PubMed Central Google ученый
Сравнение векторных и растровых методов ГИС для расчета показателей ландшафта, используемых в экологической оценке
U.S. Forest Service
Забота о земле и обслуживание людей
Министерство сельского хозяйства США
Сравнение методов векторной и растровой ГИС для расчета показателей ландшафта, используемых в экологической оценке
Автор (ы): Тимоти Г. Уэйд; Джеймс Д. Уикхэм; Малиха С. Нэш; Энн С. Нил; Курт Х. Риттерс ; К. Брюс Джонс
Дата: 2003
Источник: Фотограмметрическая инженерия и дистанционное зондирование.Vol. 69, № 12, декабрь 2003 г., стр. 1399–1405.
Серия публикаций: Научный журнал (JRNL)
PDF: Скачать публикацию (312 КБ)
Описание Аннотация
Измерения на основе ГИС, которые объединяют собственные растровые и собственные векторные данные, обычно используются в экологических оценках. Большинство этих измерений можно рассчитать с использованием растровых или векторных форматов данных и методов обработки. Растровые процессы используются чаще, потому что они могут быть значительно быстрее в вычислительном отношении, чем векторные, но при преобразовании векторных данных в растр вносятся ошибки.Эта ошибка преобразования была широко изучена и количественно оценена, но ее влияние на результаты экологической оценки не исследовалось. Мы изучили четыре измерения на основе ГИС, обычно используемых в экологических оценках примерно для 1000 водосборов в штатах Мэриленд и Вашингтон, округ Колумбия. Каждый показатель был рассчитан с использованием векторных и растровых методов, а оценочные значения сравнивались с использованием парного t-критерия, ранговой корреляции Спирмена. , и кластерный анализ. Парные t-критерии использовались для определения статистической значимости количественных различий между методами, а ранговая корреляция Спирмена и кластерный анализ использовались для оценки влияния различий на экологические оценки.Результаты парного t-теста показали значительные количественные различия между методами для трех из четырех показателей. Однако ранжирование Спирмена и кластерный анализ показали, что количественные различия не повлияют на результаты экологической оценки. Ранговые корреляции Спирмена между значениями вектора и растра были больше 0,98 для всех сравнений. Кластерный анализ привел к идентичному распределению от 88 процентов до более 98 процентов водосборов, проанализированных векторными и различными растровыми методами. Примечания к публикации- Вы можете отправить электронное письмо по адресу [email protected], чтобы запросить печатную копию этой публикации.
- (укажите именно , какую публикацию вы запрашиваете, и свой почтовый адрес.)
- Мы рекомендуем вам также распечатать эту страницу и прикрепить ее к распечатке статьи, чтобы сохранить полную информацию о цитировании.
- Эта статья была написана и подготовлена государственными служащими США в официальное время и поэтому находится в открытом доступе.
XML: Просмотр XML
Показать больше
Показать меньше
https: // www.fs.usda.gov/treesearch/pubs/6065
[PDF] Сравнение методов для мультиклассовых опорных векторных машин
ПОКАЗЫВАЕТ 1-10 ИЗ 32 ССЫЛОК
СОРТИРОВАТЬ ПО РелевантностиСамые популярные статьи Недавность
Опорные векторные машины для мультиклассовой классификации
Выделена проблема масштабирования различных SVM и предложены различные методы нормализации для решения этой проблемы, а их эффективность измерена эмпирически. Развернуть- Просмотр 1 отрывка, ссылки на методы
Классификация по нескольким категориям с помощью машин опорных векторов
В этой работе исследуется, как двухклассовые методы дискриминации могут быть расширены на случай нескольких классов, и показано, как линейное программирование (LP) и квадратичное программирование (QP) ) подходы, основанные на машине опорных векторов (SVM) Vapnik, могут быть объединены для получения двух новых подходов к проблеме многоклассов.РазвернутьОбъединение дискриминантных моделей с новыми мультиклассовыми SVM
- Y. Guermeur
- Математика, информатика
- Анализ шаблонов и приложения
- 2002
- Просмотреть 2 выдержки, справочную информацию и методы
DAG с большим запасом для мультиклассовой классификации
Представлен алгоритм DAGSVM, который работает в пространстве функций, определяемых ядром, и использует двухклассовые гиперплоскости с максимальным запасом на каждом узле принятия решений DDAG, который значительно быстрее обучается и оценивается, чем стандартный алгоритм или Max Wins, при этом сохраняя сопоставимую точность с обоими этими алгоритмами. Развернуть- Просмотреть 3 выдержки, справочные материалы, методы и справочную информацию
Тренировочные вспомогательные векторные машины: приложение для распознавания лиц
- E.Osuna, R. Freund, F. Girosi
- Математика, информатика
- Труды конференции компьютерного общества IEEE по компьютерному зрению и распознаванию образов
- 1997
- Просмотр 1 отрывок, справочная информация
Простой метод декомпозиции для машин опорных векторов
Благодаря разработке методов декомпозиции для формулировок SVM с ограниченными ограничениями показано, что выбор рабочего набора - нетривиальная задача, а простая задача. предлагается выбор, который приводит к более быстрой сходимости для сложных случаев.